Method List
Search:
-
#<< MiGA::TaxIndex
-
#<< MiGA::Taxonomy
-
CITATION MiGA::MiGA
-
DEBUG MiGA::MiGA
-
DEBUG_OFF MiGA::MiGA
-
DEBUG_ON MiGA::MiGA
-
DEBUG_TRACE_OFF MiGA::MiGA
-
DEBUG_TRACE_ON MiGA::MiGA
-
DISTANCE_TASKS MiGA::Project
-
FULL_VERSION MiGA::MiGA
-
INCLADE_TASKS MiGA::Project
-
INFO_FIELDS MiGA::Dataset
-
KNOWN_RANKS MiGA::Taxonomy
-
KNOWN_TYPES MiGA::Dataset
-
KNOWN_TYPES MiGA::Project
-
LONG_VERSION MiGA::MiGA
-
PREPROCESSING_TASKS MiGA::Dataset
-
RESULT_DIRS MiGA::Project
-
RESULT_DIRS MiGA::Dataset
-
UNIVERSE MiGA::RemoteDataset
-
VERSION MiGA::MiGA
-
VERSION_DATE MiGA::MiGA
-
#[] MiGA::Taxonomy
-
#[] MiGA::Metadata
-
#[] MiGA::Result
-
#[]= MiGA::Metadata
-
#add_child MiGA::TaxIndexTaxon
-
#add_dataset MiGA::TaxIndexTaxon
-
#add_dataset MiGA::Project
-
#add_file MiGA::Result
-
#add_files MiGA::Result
-
#add_result MiGA::Dataset
-
#add_result MiGA::Result
-
#add_result MiGA::Project
-
#check_datasets MiGA::Daemon
-
#check_project MiGA::Daemon
-
#children MiGA::TaxIndexTaxon
-
#create MiGA::Metadata
-
#create MiGA::Result
-
#create MiGA::Project
-
#daemon MiGA::Daemon
-
#data MiGA::Result
-
#data MiGA::Metadata
-
#dataset MiGA::Project
-
#datasets MiGA::TaxIndex
-
#datasets MiGA::TaxIndexTaxon
-
#datasets MiGA::Project
-
#datasets_count MiGA::TaxIndexTaxon
-
#db MiGA::RemoteDataset
-
#declare_alive MiGA::Daemon
-
#default_options MiGA::Daemon
-
#dir MiGA::Result
-
#done_preprocessing? MiGA::Dataset
-
#done_preprocessing? MiGA::Project
-
#download MiGA::RemoteDataset
-
download MiGA::RemoteDataset
-
#each MiGA::Metadata
-
#each_dataset MiGA::Project
-
#each_dataset_profile_advance MiGA::Project
-
#each_file MiGA::Result
-
#each_result MiGA::Dataset
-
exist? MiGA::Dataset
-
exist? MiGA::Metadata
-
exist? MiGA::Result
-
exist? MiGA::Project
-
#file_path MiGA::Result
-
#first_preprocessing MiGA::Dataset
-
#flush! MiGA::Daemon
-
generic_transfer File
-
#get_job MiGA::Daemon
-
#get_metadata MiGA::RemoteDataset
-
#get_ncbi_taxid MiGA::RemoteDataset
-
#get_ncbi_taxonomy MiGA::RemoteDataset
-
#highest MiGA::Taxonomy
-
#ids MiGA::RemoteDataset
-
#ignore_task? MiGA::Dataset
-
#import_dataset MiGA::Project
-
#info MiGA::Dataset
-
#initialize MiGA::RemoteDataset
-
#initialize MiGA::TaxIndexTaxon
-
#initialize MiGA::Result
-
#initialize MiGA::Daemon
-
#initialize MiGA::TaxIndex
-
#initialize MiGA::Taxonomy
-
#initialize MiGA::Metadata
-
#initialize MiGA::Dataset
-
#initialize MiGA::Project
-
initialized? MiGA::MiGA
-
#is_in? MiGA::Taxonomy
-
#is_multi? MiGA::Dataset
-
#is_nonmulti? MiGA::Dataset
-
#is_ref? MiGA::Dataset
-
#jobs_running MiGA::Daemon
-
#jobs_to_run MiGA::Daemon
-
json_create MiGA::Taxonomy
-
last_alive MiGA::Daemon
-
#last_alive MiGA::Daemon
-
#latency MiGA::Daemon
-
load MiGA::Project
-
#load MiGA::Result
-
#load MiGA::Metadata
-
load MiGA::Metadata
-
load MiGA::Result
-
#load MiGA::Project
-
#lock_file MiGA::Metadata
-
#lowest MiGA::Taxonomy
-
#maxjobs MiGA::Daemon
-
#metadata MiGA::Dataset
-
#metadata MiGA::Project
-
#miga_name String
-
#miga_name? String
-
#name MiGA::Dataset
-
#name MiGA::Project
-
#name MiGA::TaxIndexTaxon
-
#next_distances MiGA::Project
-
#next_inclade MiGA::Project
-
#next_preprocessing MiGA::Dataset
-
normalize_rank MiGA::Taxonomy
-
#options MiGA::Daemon
-
#path MiGA::Project
-
#path MiGA::Metadata
-
#path MiGA::Result
-
#ppn MiGA::Daemon
-
#profile_advance MiGA::Dataset
-
#profile_datasets_advance MiGA::Project
-
#project MiGA::Dataset
-
#project MiGA::Daemon
-
#purge! MiGA::Daemon
-
#queue_job MiGA::Daemon
-
#rank MiGA::TaxIndexTaxon
-
#ranks MiGA::Taxonomy
-
#remove! MiGA::Dataset
-
#remove! MiGA::Metadata
-
#remove! MiGA::Result
-
#restart MiGA::Daemon
-
#result MiGA::Dataset
-
#result MiGA::Project
-
#result_files_exist? MiGA::MiGA
-
#results MiGA::Dataset
-
#results MiGA::Project
-
#results MiGA::Result
-
#root MiGA::TaxIndex
-
root_path MiGA::MiGA
-
#runopts MiGA::Daemon
-
#save MiGA::Dataset
-
#save MiGA::Project
-
#save MiGA::Metadata
-
#save MiGA::Result
-
#save_to MiGA::RemoteDataset
-
#say MiGA::Daemon
-
#sorted_ranks MiGA::Taxonomy
-
#start MiGA::Daemon
-
#status MiGA::Daemon
-
#stop MiGA::Daemon
-
tabulate MiGA::MiGA
-
#tax_str MiGA::TaxIndexTaxon
-
#to_hash MiGA::TaxIndexTaxon
-
#to_json MiGA::TaxIndexTaxon
-
#to_json MiGA::TaxIndex
-
#to_json MiGA::Taxonomy
-
#to_s MiGA::Taxonomy
-
#to_tab MiGA::TaxIndexTaxon
-
#to_tab MiGA::TaxIndex
-
#universe MiGA::RemoteDataset
-
#unlink_dataset MiGA::Project
-
#unmiga_name String
-
#unregistered_datasets MiGA::Project