Method List

Classes Methods Files

Search:

#[] Mascot::DAT::SearchDatabases
#[] Mascot::DAT::Parameters
#accession Mascot::DAT::Proteins::ProteinEntry
#attributes Mascot::DAT::Query
#attrs Mascot::DAT::PSM
#boundary Mascot::DAT
#boundary_string Mascot::DAT
#byteoffset Mascot::DAT::Proteins
#charge Mascot::DAT::Query
#cleavages Mascot::DAT::Enzyme
#close Mascot::DAT
#dat_file Mascot::DAT
#dat_file Mascot::DAT::Proteins
#dbs Mascot::DAT::PSM
#decoy_peptides Mascot::DAT
#delta Mascot::DAT::PSM
#deltas Mascot::DAT::Masses
#desc Mascot::DAT::Proteins::ProteinEntry
#distribution Mascot::DAT::HeaderInfo
#each Mascot::DAT::Peptides
#each Mascot::DAT::SearchDatabases
#each Mascot::DAT::Proteins
#endbytepos Mascot::DAT::Proteins
#enzyme Mascot::DAT
#fixed_modifications Mascot::DAT::Masses
#goto Mascot::DAT
#idx Mascot::DAT::Proteins
#idx Mascot::DAT
#independent Mascot::DAT::Enzyme
#index Mascot::DAT::Query
#initialize Mascot::DAT::Enzyme
#initialize Mascot::DAT::Masses
#initialize Mascot::DAT::Query
#initialize Mascot::DAT::Parameters
#initialize Mascot::DAT::HeaderInfo
#initialize Mascot::DAT
#initialize Mascot::DAT::SearchDatabases
#initialize Mascot::DAT::PSM
#initialize Mascot::DAT::Peptides
#initialize Mascot::DAT::Proteins
#int_max Mascot::DAT::Query
#int_min Mascot::DAT::Query
#intensity Mascot::DAT::Query
#ion_series_str Mascot::DAT::PSM
#ions1 Mascot::DAT::PSM
#ions2 Mascot::DAT::PSM
#ions3 Mascot::DAT::PSM
#mass_max Mascot::DAT::Query
#mass_min Mascot::DAT::Query
#masses Mascot::DAT
#masstable Mascot::DAT::Masses
#method_missing Mascot::DAT::Parameters
#missed_cleavages Mascot::DAT::PSM
#mr Mascot::DAT::PSM
#mr Mascot::DAT::Proteins::ProteinEntry
#mz Mascot::DAT::Query
#name Mascot::DAT::Query
#names Mascot::DAT::Parameters
#next_entry Mascot::DAT::Proteins
#next_psm Mascot::DAT::Peptides
#num_ions_matched Mascot::DAT::PSM
#num_used1 Mascot::DAT::Query
#num_vals Mascot::DAT::Query
open Mascot::DAT
#parameters Mascot::DAT::Parameters
#parameters Mascot::DAT
parse Mascot::DAT::SearchDatabases
#parse Mascot::DAT::SearchDatabases
#peaks Mascot::DAT::Query
#pep Mascot::DAT::PSM
#peptides Mascot::DAT
#protein Mascot::DAT::Proteins
#proteins Mascot::DAT::PSM
#proteins Mascot::DAT
#psm Mascot::DAT::Peptides
#psmidx Mascot::DAT::Peptides
#query Mascot::DAT::PSM
#query Mascot::DAT
#rank Mascot::DAT::PSM
#read_section Mascot::DAT
#restrictions Mascot::DAT::Enzyme
#rewind Mascot::DAT::Peptides
#rewind Mascot::DAT::Proteins
#rtinseconds Mascot::DAT::Query
#score Mascot::DAT::PSM
#search_databases Mascot::DAT::HeaderInfo
#search_databases Mascot::DAT
#semi_specific Mascot::DAT::Enzyme
#terminals Mascot::DAT::Enzyme
#terms Mascot::DAT::PSM
#title Mascot::DAT::Enzyme
#title Mascot::DAT::Query
#var_mods_str Mascot::DAT::PSM