Method List
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    check_file! BigSimon::Utils
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    check_opt! BigSimon::Utils
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    collate_host_results BigSimon::Pipeline
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    heatmaps BigSimon::Runners
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    homology BigSimon::Runners
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    map_taxa BigSimon::Pipeline
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    mummer BigSimon::Runners
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    mummer2 BigSimon::Runners
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    rcode BigSimon::Utils
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    scale_log_likelihood BigSimon::Utils
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    set_up_tmp_dirs BigSimon::Utils
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    strip_suffix BigSimon::Utils
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    vir_host_matcher BigSimon::Parsers
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    vir_host_matcher BigSimon::Runners
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    wish BigSimon::Runners
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    wish BigSimon::Parsers